秸秆还田的有关技术问题为提高秸秆还田效果，避免可能产生的有害作用，在施用技术上必须注意几个问题。
一、影响秸秆腐解的因素
杨志谦的研究指出，秸秆腐解是生物化学过程，所有影响土壤生物活性的因素都对其有影响。
水分：土壤水分过多或过少都对微生物活动产生不利影响。一般认为土壤含水量在田间持水量的60%～70%最适于秸秆腐解。
温度：温度的高低不仅影响微生物群体的组成、活性，也影响土壤酶的活性。土壤温度过低，微生物活性减弱，腐解缓慢；温度过高会抑制土壤微生物活动，甚至使土壤中酶失去活性。Irtani研究表明，28～35℃范围内，温度变化不影响微生物活动，秸秆均有最大的分解率。温度对秸秆分解前期的影响比水分更为明显。
其它因素：碳氮比对腐解有一定影响，调节C/N只影响初期分解，C/N比越低秸秆初期分解越快。土壤pH值在5～8范围内，秸秆腐解速度基本一致，过酸或过碱都会抑制微生物活动，使腐解缓慢。土壤的通透性越差其秸秆腐解越慢。
二、秸秆还田必须配合施用有机肥料
Allison研究指出，秸秆含氮量少于1.2时无机氮就会被固定在有机化合物中。Parr认为，一般情况含氮量大于1.5%～1.7%的有机物就不需要补充氮，这相当于C/N比值为25～30:1。杨志谦研究认为，秸秆作为一种含碳丰富的能源物质，直接施入土壤会刺激微生物迅速繁殖，导致土壤中有效氮大量被暂时固定。玉米秸秆的C/N为53:1，C/N大于25～3O，其氮索不足，在这种情况下还田的秸秆分解缓慢，微生物与作物争夺土壤中原有的有效氮，造成氮素缺乏，不利于作物生长发育甚至造成减产。为此，在生产中必须配施一定量的氮肥。
一般认为，微生物每分解100g秸秆约需要0.8g氮，即每1000千克秸秆至少加入8千克氮才能保证分解速率不受缺氮的影响。在实施秸秆还田的前1～2年必须配合施入氮肥。我国的生产实践中提倡按秸秆干重的1%配施氮肥。对于缺磷和缺硫的土壤还应该补施适量的磷肥和硫肥。
三、翻埋的时间和数量
秸秆腐解的生物化学过程，影响土壤微生物活性的因素诸如水分、温度等都对其腐解产生影响。考虑翻埋的时间应注意上述各因素。
秸秆还田应该在秋收后立即进行，这时期玉米秸秆含水量较高，气温也较高，及时翻耕深埋有利于迅速腐解，有利于来年保墒保苗。秸秆还田的数量可根据土壤状况而定。
在较瘠薄的土壤上，施肥量不足的情况下，秸秆还田数量不宜多，一般为3000～4500千克/公顷为宜；在较肥沃的土壤上，施肥充足的条件下，还田数量可为6000～7500千克/公顷。还田后要及时耕翻，使秸秆残体分散均匀与土壤充分混合。要求耕翻18～20cm，耙平并加重镇压，避免出现架空现象，以利迅速腐解。
四、保证秸秆粉碎质量
生产实践证明，还田的秸秆粉碎的越细越好。一般以切成5～8cm长的小段为宜，否则不易覆盖，更不利于腐烂。秸秆还田采用机械作业时要求拖拉机用低档作业，这样可以增加粉碎时间和切割次数。在刚刚收获后趁玉米秸秆青绿、含水量大时进行粉碎容易保证粉碎质量。另外，秸秆腐解过程中会产生一些有机酸，直接影响作物根系的生长发育和吸收功能。为此，在酸性土壤中要施入适量的石灰，以中和有机酸并可促进分解。在秸秆腐解过程中如果土壤通气状况不良会产生植物毒素，可能抑制种子发芽，伤害作物根系。为此，应该注意采取耕作措施疏松土壤，改善土壤通气状况。
秸秆还田的技术性较强，弄不好会收不到预期效果，甚至造成减产。各地在应用这项技术时应该摸清在不同气候(温度、降水)、土壤条件(土壤类型、质地、肥力)和生产水平条件下秸秆的腐解情况，确定适宜的翻压时间、翻压数量、补氮数量，并选准过硬的还田机具。进一步探讨加速秸秆腐解的各项技术措施，查明还田的增产效益和经济效益，以便大面积的推广应用这项技术。
